MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-42

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017508	GAA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017508	A	6	6	62	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017508	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017508	AGGG	2	8	208	215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017508	A	6	6	225	230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017508	GCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017508	AGA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017508	CT	3	6	621	626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017508	AGG	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017508	CAT	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017508	T	6	6	2285	2290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017508	TTG	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017508	ACT	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017508	A	6	6	2648	2653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017508	T	6	6	2680	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017508	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017508	TA	3	6	2713	2718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017508	AAT	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017508	ATTT	2	8	2733	2740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017508	A	6	6	2776	2781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017508	G	6	6	2808	2813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017508	C	7	7	2817	2823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_017508	TCCC	2	8	2831	2838	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017508	CTCC	2	8	2849	2856	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_017508	C	6	6	2860	2865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_017508	GTTT	2	8	3033	3040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017508	AAGGA	2	10	3048	3057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017508	GGC	2	6	3058	3063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017508	TAT	3	9	3163	3171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017508	CAA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017508	TTACAC	2	12	3229	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017508	GCG	2	6	3273	3278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017508	TGCCG	2	10	3329	3338	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017508	GGA	2	6	3382	3387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017508	GGGC	2	8	3535	3542	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017508	GGGC	2	8	3621	3628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017508	CGC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017508	T	6	6	3854	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017508	T	7	7	4292	4298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017508	TAT	2	6	4334	4339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017508	TG	3	6	4857	4862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017508	AGGA	2	8	6186	6193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017508	AT	3	6	6278	6283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017508	CT	3	6	6630	6635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017508	CGG	2	6	7109	7114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017508	AAAG	2	8	9253	9260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017508	CGG	2	6	9270	9275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017508	CACC	2	8	9494	9501	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_017508	T	9	9	9522	9530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017508	CTTG	2	8	9549	9556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017508	GTA	2	6	9562	9567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017508	TGT	2	6	9568	9573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017508	ACA	2	6	9589	9594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017508	TAC	2	6	9595	9600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017508	T	6	6	10661	10666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017508	ACA	2	6	12503	12508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017508	TGC	2	6	12540	12545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017508	CGT	2	6	14201	14206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017508	TCT	2	6	14232	14237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017508	CTTTA	2	10	14245	14254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017508	AT	3	6	14267	14272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017508	AAC	2	6	14336	14341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017508	CGG	2	6	14378	14383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017508	GCC	2	6	14464	14469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017508	AG	3	6	14477	14482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017508	G	7	7	19628	19634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017508	ACC	2	6	19636	19641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017508	CTTT	2	8	26831	26838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017508	A	6	6	26858	26863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017508	CTG	2	6	28814	28819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017508	T	6	6	28834	28839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017508	TCT	2	6	28881	28886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017508	GAC	2	6	31016	31021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017508	C	6	6	31021	31026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_017508	CA	3	6	40738	40743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017508	CAG	2	6	40821	40826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.